İşletmelerde bulunan otomatik sıyırıcılarla toplanan hayvan atıkları, ilk olarak bütün tesislerin altına döşenmiş olan büyük korige borularla 4x4 m ebadında günlük gübre çukuruna aktarılmaktadır. Burada mikser yardımıyla homojen ve akışkan bir yapı kazandırılan atıklar daha sonra pompalar vasıtası ile ana borulara aktarılarak 20x4 m çapında büyük gübre çukuruna sevkedilmektedir. Büyük gübre çukurunda Seperatör sistemi kurulmuştur. Bu sistem ile katı ve sıvı gübre ayrıştırması yapılmaktadır. Katı gübreler Römorklarla araziye veya stok alanına götürülmekte, sıvı gübre ise ''sıvı gübre dağıtma römorku'' ile arazinin gübrelenmesinde kullanılmaktadır.